MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 chromosome

Total Repeats: 113047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007508	CCCG	2	8	45	52	0 %	0 %	25 %	75 %	78045557
2	NC_007508	TCG	2	6	134	139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045557
3	NC_007508	CGGT	2	8	218	225	0 %	25 %	50 %	25 %	78045557
4	NC_007508	GCG	3	9	259	267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045557
5	NC_007508	TCG	2	6	344	349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045557
6	NC_007508	GCA	2	6	356	361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045557
7	NC_007508	GCC	2	6	376	381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045557
8	NC_007508	GGC	2	6	390	395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045557
9	NC_007508	CG	3	6	412	417	0 %	0 %	50 %	50 %	78045557
10	NC_007508	TGC	2	6	428	433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045557
11	NC_007508	GCA	2	6	440	445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045557
12	NC_007508	CGGC	2	8	476	483	0 %	0 %	50 %	50 %	78045557
13	NC_007508	GCC	2	6	508	513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045557
14	NC_007508	TTC	2	6	541	546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045557
15	NC_007508	GAT	2	6	552	557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045557
16	NC_007508	CAG	2	6	604	609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045557
17	NC_007508	GCT	2	6	618	623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045557
18	NC_007508	CGA	2	6	627	632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045557
19	NC_007508	TTC	2	6	640	645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045557
20	NC_007508	TTC	2	6	673	678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045557
21	NC_007508	GCC	2	6	704	709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045557
22	NC_007508	ATC	2	6	715	720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045557
23	NC_007508	CG	3	6	740	745	0 %	0 %	50 %	50 %	78045557
24	NC_007508	GCCTG	2	10	779	788	0 %	20 %	40 %	40 %	78045557
25	NC_007508	CGAT	2	8	803	810	25 %	25 %	25 %	25 %	78045557
26	NC_007508	CCG	2	6	811	816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045557
27	NC_007508	CG	3	6	829	834	0 %	0 %	50 %	50 %	78045557
28	NC_007508	GCG	2	6	863	868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045557
29	NC_007508	CGA	2	6	879	884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045557
30	NC_007508	AAG	2	6	904	909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045557
31	NC_007508	GC	3	6	938	943	0 %	0 %	50 %	50 %	78045557
32	NC_007508	TGG	2	6	953	958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045557
33	NC_007508	CG	3	6	959	964	0 %	0 %	50 %	50 %	78045557
34	NC_007508	TGC	2	6	1022	1027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045557
35	NC_007508	GC	3	6	1026	1031	0 %	0 %	50 %	50 %	78045557
36	NC_007508	AGA	2	6	1064	1069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045557
37	NC_007508	TAC	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045557
38	NC_007508	CTG	2	6	1105	1110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045557
39	NC_007508	GCG	2	6	1116	1121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045557
40	NC_007508	CGCT	2	8	1126	1133	0 %	25 %	25 %	50 %	78045557
41	NC_007508	GC	3	6	1135	1140	0 %	0 %	50 %	50 %	78045557
42	NC_007508	GCCG	2	8	1213	1220	0 %	0 %	50 %	50 %	78045557
43	NC_007508	ACCAC	2	10	1223	1232	40 %	0 %	0 %	60 %	78045557
44	NC_007508	TGC	2	6	1235	1240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045557
45	NC_007508	TGCC	2	8	1242	1249	0 %	25 %	25 %	50 %	78045557
46	NC_007508	GGAC	2	8	1719	1726	25 %	0 %	50 %	25 %	78045558
47	NC_007508	TGG	2	6	1778	1783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045558
48	NC_007508	GC	3	6	1816	1821	0 %	0 %	50 %	50 %	78045558
49	NC_007508	GC	3	6	1839	1844	0 %	0 %	50 %	50 %	78045558
50	NC_007508	CCGT	2	8	1951	1958	0 %	25 %	25 %	50 %	78045558
51	NC_007508	CGT	2	6	1983	1988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045558
52	NC_007508	CAG	2	6	2044	2049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045558
53	NC_007508	CTA	2	6	2058	2063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045558
54	NC_007508	TGT	2	6	2075	2080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045558
55	NC_007508	TGC	2	6	2099	2104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045558
56	NC_007508	CGG	2	6	2163	2168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045558
57	NC_007508	ATC	2	6	2182	2187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045558
58	NC_007508	CTG	2	6	2221	2226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045558
59	NC_007508	GCG	2	6	2285	2290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045558
60	NC_007508	GC	3	6	2394	2399	0 %	0 %	50 %	50 %	78045558
61	NC_007508	GC	3	6	2483	2488	0 %	0 %	50 %	50 %	78045558
62	NC_007508	CGA	2	6	2541	2546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045558
63	NC_007508	GTG	2	6	2611	2616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045558
64	NC_007508	CAG	2	6	2661	2666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045558
65	NC_007508	CGAT	2	8	3744	3751	25 %	25 %	25 %	25 %	78045559
66	NC_007508	CTG	2	6	3828	3833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045559
67	NC_007508	CAA	2	6	3933	3938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78045559
68	NC_007508	TGGAA	2	10	3964	3973	40 %	20 %	40 %	0 %	78045559
69	NC_007508	GGACG	2	10	4039	4048	20 %	0 %	60 %	20 %	78045559
70	NC_007508	GC	3	6	4078	4083	0 %	0 %	50 %	50 %	78045559
71	NC_007508	TGCGC	2	10	4086	4095	0 %	20 %	40 %	40 %	78045559
72	NC_007508	GTG	2	6	4101	4106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045559
73	NC_007508	GTGGCG	2	12	4138	4149	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	78045559
74	NC_007508	CGC	3	9	4155	4163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045559
75	NC_007508	GC	3	6	4264	4269	0 %	0 %	50 %	50 %	78045559
76	NC_007508	CTG	2	6	4467	4472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045559
77	NC_007508	GC	3	6	4476	4481	0 %	0 %	50 %	50 %	78045559
78	NC_007508	GGACG	2	10	4560	4569	20 %	0 %	60 %	20 %	78045559
79	NC_007508	GCCT	2	8	4605	4612	0 %	25 %	25 %	50 %	78045559
80	NC_007508	GGA	2	6	4625	4630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78045559
81	NC_007508	GAT	2	6	4671	4676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045559
82	NC_007508	TGC	2	6	4714	4719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045559
83	NC_007508	TCA	2	6	4750	4755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045559
84	NC_007508	GCA	2	6	4802	4807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045559
85	NC_007508	CGA	2	6	4976	4981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045560
86	NC_007508	TGC	2	6	5035	5040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045560
87	NC_007508	GGT	2	6	5126	5131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045560
88	NC_007508	CGA	2	6	5144	5149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045560
89	NC_007508	GAC	2	6	5169	5174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045560
90	NC_007508	GTG	2	6	5178	5183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045560
91	NC_007508	GCG	2	6	5227	5232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
92	NC_007508	GAA	2	6	5253	5258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045560
93	NC_007508	CGG	2	6	5266	5271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
94	NC_007508	TGC	2	6	5290	5295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045560
95	NC_007508	CGG	2	6	5300	5305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
96	NC_007508	CGA	2	6	5312	5317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045560
97	NC_007508	CGG	2	6	5336	5341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
98	NC_007508	GGT	2	6	5363	5368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045560
99	NC_007508	CAG	2	6	5424	5429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045560
100	NC_007508	AGC	2	6	5464	5469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045560
101	NC_007508	CAC	2	6	5492	5497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045560
102	NC_007508	CCGT	2	8	5511	5518	0 %	25 %	25 %	50 %	78045560
103	NC_007508	GGCGC	2	10	5558	5567	0 %	0 %	60 %	40 %	78045560
104	NC_007508	TCCT	2	8	5580	5587	0 %	50 %	0 %	50 %	78045560
105	NC_007508	CGA	2	6	5615	5620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045560
106	NC_007508	GCG	2	6	5623	5628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
107	NC_007508	CGA	2	6	5639	5644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045560
108	NC_007508	GGC	2	6	5658	5663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
109	NC_007508	CGC	2	6	5701	5706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045560
110	NC_007508	CAT	2	6	5747	5752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045560
111	NC_007508	CAA	2	6	5810	5815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78045560
112	NC_007508	CGG	2	6	5831	5836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
113	NC_007508	CACC	2	8	5837	5844	25 %	0 %	0 %	75 %	78045560
114	NC_007508	GCG	2	6	5859	5864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
115	NC_007508	CG	3	6	5869	5874	0 %	0 %	50 %	50 %	78045560
116	NC_007508	CGG	2	6	6040	6045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
117	NC_007508	GC	3	6	6063	6068	0 %	0 %	50 %	50 %	78045560
118	NC_007508	CGAA	2	8	6094	6101	50 %	0 %	25 %	25 %	78045560
119	NC_007508	TCG	2	6	6124	6129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045560
120	NC_007508	GC	6	12	6135	6146	0 %	0 %	50 %	50 %	78045560
121	NC_007508	GCC	2	6	6150	6155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045560
122	NC_007508	GC	3	6	6162	6167	0 %	0 %	50 %	50 %	78045560
123	NC_007508	CGC	2	6	6177	6182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045560
124	NC_007508	TCG	2	6	6265	6270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045560
125	NC_007508	CGG	2	6	6280	6285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
126	NC_007508	TGC	2	6	6328	6333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045560
127	NC_007508	CGA	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045560
128	NC_007508	ACC	2	6	6469	6474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045560
129	NC_007508	CAT	2	6	6476	6481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045560
130	NC_007508	TGA	2	6	6484	6489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045560
131	NC_007508	CCGACG	2	12	6490	6501	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	78045560
132	NC_007508	CTG	3	9	6525	6533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045560
133	NC_007508	CTT	2	6	6536	6541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045560
134	NC_007508	CTACAT	2	12	6575	6586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045560
135	NC_007508	GCC	2	6	6593	6598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045560
136	NC_007508	GAC	2	6	6642	6647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045560
137	NC_007508	GCG	2	6	6648	6653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
138	NC_007508	GCG	2	6	6690	6695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
139	NC_007508	CGA	2	6	6710	6715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045560
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248	NC_007508	CCG	2	6	11367	11372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045564
249	NC_007508	CCG	2	6	11379	11384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045564
250	NC_007508	GTGGAT	2	12	11427	11438	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	78045564
251	NC_007508	GTCG	2	8	11462	11469	0 %	25 %	50 %	25 %	78045564
252	NC_007508	GCA	2	6	11514	11519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045564
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257	NC_007508	TCA	2	6	11873	11878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045565
258	NC_007508	CAC	2	6	11922	11927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045565
259	NC_007508	GAA	2	6	11974	11979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045565
260	NC_007508	CGC	2	6	12018	12023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045565
261	NC_007508	GCT	2	6	12028	12033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045565
262	NC_007508	CAC	2	6	12037	12042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045565
263	NC_007508	GCA	2	6	12056	12061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045565
264	NC_007508	TCG	2	6	12098	12103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045565
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266	NC_007508	TCG	2	6	12194	12199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045565
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